致力於A群鏈球菌(Group A
Streptococcus,又名Streptococcus
pyogenes)的研究:A群鏈球菌又名嗜肉菌,臨床上造成致命的壞死性筋膜炎、鏈球菌毒性休克症候群等疾病,林俊農醫師長期投入這領域的研究,率先發現台灣地區流行病學與世界各地的差異性,例如A群鏈球菌emm106分型,為造成侵襲性A群鏈球菌皮膚及軟組織感染最重要的細菌分型、A群鏈球菌毒性休克症候群主要菌株為emm102細菌分型、fluoroquinolone
nonsusceptible之A群鏈球菌主要流行菌株為emm12/ST36基因型細菌,此一系列研究連續發表6篇論文於國際著名SCI期刊。