針對疫情指揮中心於112年2月6日要求開立或調劑COVID-19口服抗病毒藥物之醫事機構進行藥物使用與流向自主清查作業，已造成院所極大作業負擔。
本會鑑於疫情尚未平息，醫療院所除一般醫療照護工作外，每日仍有不斷新增的確診個案須進行照護，為避免造成院所行政負擔，本會於112年2月17日以全醫聯字第1120000199號函，請疫情指揮中心調整作業方式，以核對「智慧防疫物資管理系統」及「健保IC卡上傳口服抗病毒藥物登錄耗用量」兩者數據有短差之院所，再個別行文通知補正即可。
另，本會考量健保IC卡上傳無法糾錯，導致「智慧防疫物資管理系統」及健保IC卡上傳資料進行勾稽時，兩者數據有落差，爰於2月18日以全醫聯字第1120000211號函，建議可改以院所申報資料進行勾稽與「智慧防疫物資管理系統」進行比對，如此可大幅降低兩者間之誤差，使抗病毒藥物之追蹤更為精確，並請疫情指揮中心體察疫情緊急之時醫療院所業務繁忙及健保IC卡上傳無法糾錯之困擾，避免增加醫療院所額外行政負擔，以利醫療院所持續專心防疫，守護人民健康。
