本會於112年2月17日以全醫聯字第1120000199號函，請疫情指揮中心調整作業方式，以核對「智慧防疫物資管理系統」及「健保IC卡上傳口服抗病毒藥物登錄耗用量」兩者數據有短差之院所，再個別行文通知補正即可。另，本會考量健保IC卡上傳無法糾錯，導致「智慧防疫物資管理系統」及健保IC卡上傳資料進行勾稽時，兩者數據有落差，爰於2月18日以全醫聯字第1120000211號函，建議可改以院所申報資料進行勾稽與「智慧防疫物資管理系統」進行比對。
疫情指揮中心針對本會上述建議於2月24日函覆，重點略以:疫情指揮中心業於2月22日調整實施時程及相關清查作業，期限延至3月31日，並提供「智慧防疫物資管理系統」及「健保IC卡上傳口服抗病毒藥物登錄耗用量」統計資料，俾利降低醫事機構比對資料負擔。
